（一）引言：

? 過渡態(tài)搜索是計算化學中一個很重要的內(nèi)容，它研究化學反應動力學方面的信息。過渡態(tài)搜索將分為多個部分進行介紹。在教程（三）中，我們介紹了使用Opt=calcall聯(lián)合大小基組方法尋找過渡態(tài)的方法。但在某些體系中，如果反應區(qū)域外的部分結構還遠離平衡點，則會存在方法失效的情況。

? 本文作為第三部分將給初學者介紹另外一種過渡態(tài)尋找方法，即運用Scan關鍵詞掃描勢能面，得到一個合理的初始結構的方法。此方法比前面介紹的方法耗時，可以在其它方法搜索過渡態(tài)失敗的時候使用。

? 本文將用2個不同反應，介紹這個方法的使用細節(jié)和需要注意的地方。

█ H + CH₄ → CH₃ + H₂ (1)

█ (2)

（二）計算過程—反應1：

1. 過渡態(tài)結構分析
█ 軟件版本Gaussian 16, GaussView 6。使用模型化學方法 B3LYP/6-31+G(d)
█ 在教程（五）中我們介紹過，過渡態(tài)結構就是處于舊鍵并未完全斷裂而新鍵又并未完全形成的狀態(tài)。因此，可以使用冗余內(nèi)坐標掃描的方法對舊鍵（將要斷裂的鍵）或新鍵（將要形成的鍵）進行掃描。掃描結束后，查看在舊鍵斷裂和新鍵形成時的勢能變化曲線。

2. 添加冗余坐標
█ 先將反應物畫好，然后點擊GaussView上的圖標，如下圖所示：

◆ 第一步點擊Add選項，然后第二步選擇Bond選項，第三步在繪圖窗口點擊C1和C4（即我們要掃描的坐標），第四部選擇Scan Coordinate對坐標進行掃描，第五步寫入50，0.03代表掃描50步，每步掃描0.03?。

█ 定義好冗余坐標之后，點擊Calculation Setup面板，顯示如下：

◆ 可以看到Job Type選項中已自動設置為Scan，關鍵詞中也可以看到，使用opt=modredundant進行冗余坐標優(yōu)化。然后設置好方法和基組，提交作業(yè)。

3. 查看計算結果
█ 計算完成后打開log文件，然后點擊Results → Scan，可以看到掃描冗余坐標得到的勢能面為：

4. 過渡態(tài)搜索(Opt=TS)
█ 然后點擊能量最高的一個點，用這個點對應的結構作為過渡態(tài)的初始猜測結構。使用教程（五）中的方法搜索過渡態(tài)(Opt=TS)，即可以得到最終的過渡態(tài)構型。下圖為掃描得到的能量最高點結構（左）以及優(yōu)化得到的過渡態(tài)構型（右）：

◆ 從結果可以看出，掃描得到的初始猜測結構與最終的過渡態(tài)結構極為類似，因此使用冗余坐標掃描進行過渡態(tài)猜測是一個可行的方法。

◆ 此外,研究者有時將Scan得到的勢能面上的最高點來近似過渡態(tài)，在一般情況下是可以接受的，但在某些情況下會相差較大，所以需要謹慎使用。

(三) 計算過程—反應2：

1. 對于第二個反應，我們同樣使用上述方法進行勢能面掃描。（此處不再給出操作細節(jié)）
█ 掃描結果如下。從結果可以看出這個H轉(zhuǎn)移過程是能量逐漸下降的過程，因此反應路徑上可能不存在過渡態(tài)。我們使用了多種方法對這一反應過渡態(tài)進行搜索，的確沒有搜索到過渡態(tài)，因此冗余坐標掃描方法也可以作為確定某反應是否有過渡態(tài)的一種參考方法。