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教程(十六)AMPAC專業(yè)級(jí)半經(jīng)驗(yàn)量子力學(xué)模塊安裝
(一)引言:
? AMPAC是Semichem公司開發(fā)的一款半經(jīng)驗(yàn)量子化學(xué)軟件包。Gaussview 6包含了AMPAC獨(dú)立的圖形界面端口,您可以使用它創(chuàng)建輸入文件、運(yùn)行作業(yè)和以及圖形化方式查看結(jié)果。
? AMPAC的功能主要包括:
█ 化學(xué)反應(yīng)模擬
◆ 過(guò)渡態(tài)及多個(gè)極小值搜索,高效優(yōu)化方法,快速穩(wěn)態(tài)尋找,勢(shì)能面掃描,內(nèi)稟反應(yīng)坐標(biāo)
█ 性質(zhì)模擬
◆ 生成焓及其它熱力學(xué)性質(zhì),振動(dòng)光譜,偶極矩,極化率及超極化率,電子光譜,電子自旋共振光譜,電荷分布,鍵級(jí),自旋密度,原子電荷,激發(fā)態(tài)
█ 定量構(gòu)效關(guān)系(QSAR)
█ 模擬退火構(gòu)象搜索
(二)計(jì)算過(guò)程:
1. 安裝Gaussian 16, GaussView 6
█ 假定已經(jīng)安裝好Gaussian 16, GaussView 6。(此處不再介紹關(guān)于Gaussian 16, GaussView 6軟件的安裝)
█ 假定Gaussian 16, GaussView 6安裝路徑為D:/G16W/
2. AMPAC安裝
█ 雙擊steup.exe圖標(biāo),會(huì)出現(xiàn)以下界面:
█ 點(diǎn)擊Next,然后輸入用戶名、公司名及序列號(hào):
█ 選擇AMPAC安裝的路徑,此時(shí)建議安裝在G16的路徑下,然后點(diǎn)擊Next及install。
█ 安裝完成后有如下提示界面:
3. AMPAC功能測(cè)試
█ 甲酰胺雙分子的結(jié)構(gòu)優(yōu)化。首先構(gòu)建初始結(jié)構(gòu),如下圖:
█ 點(diǎn)擊Calculate面板下Ampac Calculation Setup功能
█ 選擇Method中的PM7方法優(yōu)化
█ 優(yōu)化結(jié)果如下圖:
█ APMAC程序可以與Gaussian軟件有機(jī)結(jié)合,大大加強(qiáng)了Gaussian的功能。后面我們將逐步介紹AMPAC的功能以及如何與Gaussian 軟件聯(lián)用來(lái)解決實(shí)際問(wèn)題。
█ AMPAC安裝目錄下有使用手冊(cè),位置在ampacmanual文件夾下,用戶可以打開此文件進(jìn)行學(xué)習(xí)。另外也可以通過(guò)其官網(wǎng)進(jìn)行更多了解:http://www.semichem.com/ampac/afeatures.php
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