數(shù)據(jù)結(jié)果的圖形化

非諧振頻率分析

GaussView 6 可以顯示IR, Raman, VCD及ROA的諧振和非諧振光譜結(jié)果，所預測非諧振峰、強度將同諧振峰、強度同時顯示（同時包括倍頻及組合峰）。

所得譜圖可以圖片形式展示，包括獨立展示或者同時在單個圖中展示。例如，下圖左邊展示的是VCD光譜的諧振光譜，中間部分展示的則是VCD光譜的非諧振光譜，右邊展示的則是兩者的組合光譜。

PCM溶劑模型孔洞

GaussView 6 可以展示SCRF溶劑模型的孔洞，既可用全色展示，又可用網(wǎng)格和點展示，溶劑模型孔洞可根據(jù)用戶喜好選定。例如，下圖所示的原子孔洞表面可以用特定顏色展示（此表面已設置為透明）。

ORD（旋光色散光譜）

GaussView 6 可以展示旋光色散光譜計算的結(jié)果。分子組（molecule group）中每個分子的ORD光譜都能單獨展示。下圖所示為五個分子在特定激發(fā)頻率下的ORD光譜，其中每個點為特定波長下所預測的旋光度。

電子振動光譜

GaussView 6 能展示電子振動分析結(jié)果，諸如電子振動光譜以及Duschinky矩陣。例如，下圖展示的是單光子吸收電子振動光譜。躍遷(blue sticks)，躍遷對應的光譜(red curve)及最終的光譜(black curve)都能同時展示。

下圖展示的是每對始態(tài)和終態(tài)的Duschinsky重疊矩陣，顏色從白色(0% overlap)到全色(100% overlap)標注。例如，我們可以看見在40左右始態(tài)和終態(tài)的重疊系數(shù)在 40-60%左右。

更加完善的計算總結(jié)

GaussView 6 可以顯示更多的計算結(jié)果：

●  Overview 欄顯示計算得到的重要信息，新增溶劑化模型及極化率信息。

●  Thermo 欄只有在進行頻率計算后才會顯示，它可以顯示各種熱力學值。

●  Opt 欄只有在進行幾何優(yōu)化之后才會顯示，它可以顯示當前優(yōu)化下的收斂情況，包括maximum, RMS force, displacement及能量變化。

保存視頻文件

你可以使用GaussView6 來保存正則振動動畫及振動模（MP4格式）。當保存正則振動動畫時，你可以指定重復的頻率、向前（或后）播放、調(diào)整振動速度和流暢性等。振動動畫可以指定位移幅度、展示矢量位移及偶極矩等。

組合圖

GaussView 6 可以從多個文件中以組合圖的形式查看結(jié)果。主要功能如下：

●  可以改變線、短線以及兩者組合的意義。

●  指定線\短線的特征，包括粗細及顏色。

●  繪制組合線以及指定其外觀。

●  對每個數(shù)據(jù)分配權(quán)重，包括Boltzmann平均。例如，下圖展示的是4個構(gòu)象的VCD光譜以及Boltzmann分布下的VCD光譜(dashed green line)，我們可以得知組合光譜圖中構(gòu)象1所占比重最高。

計算設置新功能

一步設置多個作業(yè)

GaussView 6可以通過幾步簡單操作對一個分子組(molecule group)進行Gaussian作業(yè)設置。過程如下：

●  確保所有分子都在一個分子組(molecule group)中。

●  在Gaussian Calculation Setup欄中按正常步驟來設置job type, model chemistry, title及其它關(guān)鍵詞。 

●  點擊Assign to Molecule Group 按鈕，使上述設定應用到分子組中的所有分子上。

●  保存時，設置 Save Molecule Group為每個分子創(chuàng)建獨立文件。前綴及（或）分子編號可以加入到每個文件當中。

●  在下例中，我們通過構(gòu)象搜索得到了84個分子。我們將作業(yè)設置為Opt+Freq，然后應用到分子組中的每個分子上，當保存時，每個分子將會產(chǎn)生獨立的輸入文件。

GMMX 構(gòu)象搜索

GaussView 6 可以使用新增GMMX模塊進行構(gòu)象搜索。你可以通過以下一種或多種方法進行構(gòu)象搜索：

●  對于 Cartesian 搜索，每個重原子將在X, Y, Z方向上隨機移動一個距離。此方法在尋找局域最小值（local minima）時較為有效。

●  對于Bonds方法，每個已選擇的鍵將會隨機旋轉(zhuǎn)一個值，這會使分子構(gòu)象產(chǎn)生較大變化。此方法在尋找局域最小值間的相互轉(zhuǎn)化時較為有效。

●  對于環(huán)狀化合物，在Bonds方法中提供了Ringmaker策略。它將打開環(huán)中的一根鍵，旋轉(zhuǎn)其余鍵，然后再試圖重新閉環(huán)。如果閉環(huán)之后的鍵長及鍵角不合理，那么此構(gòu)象將不會采納，程序?qū)M入下一個可能的搜索。此方法對于8元環(huán)（或更大環(huán)）這樣易變形的分子較為有效。而對于不易變形的環(huán)狀化合物，此方法則效果不佳。對于這種情況， Cartesian 搜索方法則較為有效。

一旦GMMX 搜索完成，所有的構(gòu)象信息將會列出，你可以使用GaussView 6以單個分子組形式打開和查看。同樣，你可以查看這些構(gòu)象的能量。

SC作業(yè)管理系統(tǒng)

SC作業(yè)管理系統(tǒng)是為局域網(wǎng)計算機而設置的隊列系統(tǒng)（已載入GaussView 6中的服務器）。可以設置作業(yè)、加入一個隊列及無需任何操作的情況下自動運行等。

在SC作業(yè)管理系統(tǒng)中有3個獨立的隊列，每個隊列可以指定同時運行的作業(yè)數(shù)量。作業(yè)的狀態(tài)可以通過SC作業(yè)管理系統(tǒng)中的Running Jobs及Finished Jobs 欄查看。SC作業(yè)管理系統(tǒng)也可以編輯作業(yè)類型（job types）、定義默認隊列及其它高級設置。

對稱性

GaussView中的點群對稱性功能可以讓你提高當前分子的對稱性，可以限制一個分子為特定點群，之后的所有操作將會保持此對稱性。

GaussView 6 允許降低當前分子的對稱性。對于Jahn-Teller扭曲來說，保持某些分子的對稱性對計算設置來說很有效，下圖所示分子點群由D_3h 變?yōu)镈₃。

刷選工具

GaussView6 提供三種不同的工具來選擇分子中的原子，最新的工具為刷選(brush selection)。此工具主要用于在緊密簇中快速選定原子。

作業(yè)設置新功能

Gaussian Calculation Setup欄增加了許多新功能：

●  A: Job Preview 面板顯示所生成的輸入文件內(nèi)容。

●  B: 可以從checkpoint文件中提取數(shù)據(jù)以及直接定義%OldChk。

●  C: 可以指定作業(yè)最大硬盤使用量。

●  D: 新增作業(yè)類型（job types），包括polarizabilities及ORD.

●  E: 提供一個擴展面板用于指定布局分析。

●  F: 支持Gaussian 16 新功能。例如anharmonic IR/Raman, VCD及ROA計算。

●  G: 可查看Default.Route文件內(nèi)容。